Яблоня маньчжурская, которой исполнилось около 150 лет, служит живым напоминанием о военных годах. В период блокады Ленинграда около неё случился взрыв бомбы. В ту роковую ночь в ноябре 1941 года была утрачена вся тропическая коллекция, однако некоторые кактусы всё же удалось спасти благодаря усилиям сотрудников. Самые чувствительные к холоду кактусы они забирали в свои дома, согревали при помощи буржуек, лечили от обморожений и обрабатывали углём. В это время в оранжереях продолжали выращивать овощи и лекарственные растения.
Во время блокады огороды появлялись по всему Ленинграду, в том числе на Исаакиевской площади, Марсовом поле и в садах Русского музея. В Летнем саду капусту, свёклу и морковь высаживали даже в виде привлекательно оформленных бордюров. Статуи бережно прятали в землю, помещая в деревянные футляры. Свыше 300 деревьев не дожили до Победы, но на дрова их не использовали.
В Михайловском саду пионеры вместе со своим учителем приходили, чтобы ухаживать за растениями. Они использовали кисти на длинных шестах и ведра с известкой, чтобы дезинфицировать раны на стволах и собирать ветки. В Летнем саду чудом уцелел почти четырёхвековой дуб, рядом с которым растёт небольшой саженец, посаженный детьми войны, о чём сообщает телеканал "Санкт-Петербург".
Ранее президент Российской Федерации Владимир Путин охарактеризовал блокаду Ленинграда как преступление против человечности. Он выразил мнение, что события Холокоста и блокады Ленинграда напоминают о зверствах нацизма.